Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VNN3Q9NY84 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VNN3Q9NY84 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms