Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms