Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTPS2Q9NRF8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms