Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RAB9BQ9NP90 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB9BQ9NP90 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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