Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC52A2Q9HAB3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC52A2Q9HAB3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms