Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms