Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB2BQ9BVA1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms