Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EBF4Q9BQW3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms