Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNN2Q99439 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms