Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UBE2E2Q96LR5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms