Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms