Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCTD12Q96CX2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCTD12Q96CX2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms