Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFKQ969G6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFKQ969G6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RFKQ969G6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms