Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GIPC3Q8TF64 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GIPC3Q8TF64 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms