Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FAT3Q8TDW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FAT3Q8TDW7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FAT3Q8TDW7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FAT3Q8TDW7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FAT3Q8TDW7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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