Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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GDPD1Q8N9F7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GDPD1Q8N9F7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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