Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms