Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC80Q76M96 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC80Q76M96 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms