Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM72Q6ZMU5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms