Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZRN4Q6ZMN7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms