Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYC1

CLVS2, Clavesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2Q5SYC1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLVS2Q5SYC1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLVS2Q5SYC1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms