Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2NLQ5JXB2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms