Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SEC23BQ15437 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEC23BQ15437 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms