Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PUM3Q15397 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PUM3Q15397 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms