Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCOLCEQ15113 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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