Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSPNQ14714 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSPNQ14714 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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