Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4AQ13619 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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