Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL3Q13618 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL3Q13618 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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