Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF5Q13568 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IRF5Q13568 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms