Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE3BQ13370 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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