Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAA1Q13131 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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