Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCRN3Q0VDG4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms