Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLFN5Q08AF3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms