Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TGM3Q08188 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms