Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NOTCH2Q04721 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms