Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBE1Q04446 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBE1Q04446 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms