Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBA52P62987 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBA52P62987 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBA52P62987 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms