Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P62684 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms