Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMD4P55036 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms