Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA2D1P54289 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D1P54289 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms