Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP153P49790 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP153P49790 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP153P49790 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP153P49790 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP153P49790 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUP153P49790 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP153P49790 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms