Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRP9P49458 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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