Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TM4SF1P30408 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms