Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSSP25774 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms