Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERBB3P21860 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms