Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF1BP20333 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF1BP20333 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF1BP20333 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF1BP20333 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF1BP20333 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TNFRSF1BP20333 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF1BP20333 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms