Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CXCL3P19876 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms