Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms