Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC2P0DI81 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAPPC2P0DI81 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms