Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPAG9O60271 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
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